1.1. Актуальные для ВС РФ линии SARS-CoV-2, эпидемиологические особенности

Коронавирусы (Coronaviridae) - это большое семейство РНК-содержащих вирусов, способных инфицировать как животных (их естественных хозяев), так и человека. По результатам серологического и филогенетического анализа коронавирусы разделяются на четыре рода: Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus и Deltacoronavirus.

У людей коронавирусы могут вызвать целый ряд заболеваний - от легких форм острой респираторной инфекции (ОРВИ) до тяжелого острого респираторного синдрома (ТОРС или SARS). В настоящее время среди населения циркулируют четыре сезонных коронавируса (HCoV-229E, -OC43, -NL63 и -HKU1), которые круглогодично присутствуют в структуре ОРВИ, и, как правило, вызывают поражение верхних дыхательных путей легкой и средней степени тяжести, а также три высокопатогенных коронавируса - SARS, MERS и новой коронавирусной инфекции COVID-19 (SARS-CoV-2).

До января 2021 года в России основными были "российские" разновидности линии Ухань (альфа-вариант): B1.1, B1.1.317, B1.1.397. С начала 2021 года для Вооруженных Сил, как и в целом для Российской Федерации, актуальными линиями SARS-CoV-2 являются:

Альфа-вариант - Британский штамм (B.1.1.7 UK, N501Y. ОНП гена, кодирующего S-белок: A570D, P681H, T716I, S982A, D1118H). Циркулирует с начала 2021 года в России, его доля нарастала, однако после появления так называемого "Индийского варианта" с конца мая - июня 2021 г. рост прекратился.

Другие альфа-варианты. Линия B.1.1.370.1 - Северо-западный штамм. Был впервые зафиксирован в январе - феврале 2021 года. Структурно близок к Уханьскому и Британскому варианту. Территория распространения - Санкт-Петербург, Псковская область. По данным ПЦР-скрининга, в начале мая 2021 года доля этого варианта составляла 16% госпитализируемых. Данный штамм выявлялся в Москве, Новгородской области, Германии, Финляндии, Великобритании, Израиле.

Линия B 1.1.523 - Московский штамм. Имеет сходство с Британским и Уханьским вариантом SARS-CoV-2. Количество инфицированных данной линией SARS-CoV-2 медленно нарастает (данные НИИ гриппа им. Смородинцева). Впервые был обнаружен в Москве. Сейчас есть данные о распространении в Центральном федеральном округе.

Бета-вариант - Южноафриканский штамм (B.1.351 SA. ОНП гена, кодирующего S-белок: D80A, D215G, K417N, A701V, N501Y, E484K). Приобрел мутации, которые делают его менее заметным для иммунной системы человека. Отличается тем, что от него страдает больше молодых и исходно здоровых людей. На территории РФ выявлялся в Амурской области.

Дельта-вариант - Индийский штамм (Delta, B.1.617.1-2-3, India. ОНП гена, кодирующего S-белок: L452R, T478K, D614G, P681R). Зарегистрирован более чем в 90 странах мира. Быстро распространяется в Европе. В России активно вытесняет Британский вариант со второй половины апреля 2021 г. Среди образцов, полученных в Санкт-Петербурге в мае, вариант дельта составил чуть больше половины, а уже среди июньских образцов - почти 90%. На сегодняшней день является наиболее актуальным для РФ и ВС возбудителем инфекции, вызванной SARS-CoV-2.

Особенности эпидемиологии Дельта-варианта SARS-CoV-2.

Предполагается, что нуклеотидные замены в гене, кодирующем рецептор-связывающий домен S-протеина SARS-CoV-2, определяют более высокую прочность фиксации (аффинность) вируса к АПФ 2 типа. Кроме того считается, что заразительность данного варианта SARS-CoV-2 выше, чем у исходного штамма (1 больной заражает 5 человек, изначально, соотношение составляло 1:2,2). В то же время по данным европейского центра по контролю за инфекционными заболеваниями достоверных сведений, основанных на анализе репрезентативного массива данных, о более высокой заразности и летальности дельта варианта SARS-CoV-2 нет. Имеются предварительные результаты, опубликованные только в средствах массовой информации и доложенные на онлайн-конференциях, что сыворотки, полученные от вакцинированных Pfizer/BnT (США), AstraZeneca (Великобритания), Covaxin (Индия), Спутник V (Россия) эффективно нейтрализуют данный штамм возбудителя. Данные, полученные из различных клинических центров, свидетельствуют о сокращении инкубационного периода до 5 суток. Имеются неоднозначные сведения о клинически значимых механизмах передачи инфекции: фекально-оральный и бытовой (описаны в Индии), аэрозольный (воздушно-капельный путь преимущественно реализуется в регионах с удовлетворительными санитарно-бытовыми условиями, в т.ч. в России).

1.2 Подозрительный на COVID-19 случай: клинические проявления острой респираторной инфекции (температура тела выше 37,5 °C и один или более из следующих признаков: кашель - сухой или со скудной мокротой, одышка, ощущение заложенности в грудной клетке, насыщение крови кислородом по данным пульсоксиметрии (SpO₂) 95%, боль в горле, заложенность носа или умеренная ринорея, нарушение или потеря обоняния (гипосмия или аносмия), потеря вкуса (дисгевзия), конъюнктивит, слабость, мышечные боли, головная боль, рвота, диарея, кожная сыпь) при отсутствии других известных причин, которые объясняют клиническую картину вне зависимости от эпидемиологического анамнеза.