Рекомендуемый шаблон для сбора и ввода данных локального мониторинга АМР

Рекомендуемый шаблон

для сбора и ввода данных локального мониторинга АМР

С целью стандартизации формата хранения данных мониторинга АМР и их последующего анализа необходимо разработать шаблон для сбора и ввода данных. Разработка шаблона должна осуществляться одновременно с модификацией (или разработкой) бланка направления на МИ, так как последний является основным источником информации для шаблона данных мониторинга АМР. В данном разделе представлен базовый вариант шаблона данных, а также принципы его заполнения.

Таблицы, соответствующие данному шаблону должны быть доступны для выгрузки из лабораторной информационной системы (ЛИС), а в случае отсутствия ЛИС - должны выгружаться из лабораторного журнала или вестись на базе электронных таблиц. Указанные таблицы необходимы для загрузки в системы обработки данных мониторинга АМР.

Пример файла таблицы с описанием столбцов: https://amrcloud.net/files/rus-amrcloud-example-dataset-with-comments.xlsx (представленный файл содержит дополнительные комментарии для понимания структуры таблицы, его не рекомендуется загружать в системы обработки данных мониторинга АМР; файлы, пригодные для загрузки можно скачать ниже.).

Пример файла для загрузки в формате .xlsx: https://amrcloud.net/files/rus-amrcloud-example-dataset.xlsx.

Пример файла для загрузки в формате .csv: https://amrcloud.net/files/rus-amrcloud-example-dataset.csv.

Общий список наименований АМП, для использования в таблицах данных (для наименования столбцов, содержащих результаты определения чувствительности): https://amrcloud.net/files/amrcloud-antibiotics-classified.xlsx.

Таблица 1. Описание столбцов, содержащихся в таблице данных для загрузки в системы обработки данных мониторинга АМР

Столбец

Примеры значений

Особенности

Идентификатор изолята

1AB

Уникальный идентификатор

Дата

16.12.2018

Дата взятия материала Единый формат написания

Вид МО

Klebsiella pneumoniae

Полное наименование микроорганизма Английский вариант

Группа МО

Enterobacterales

Указать род/порядок и т.д. Единое оформление по всему столбцу Английский вариант

Antibiotic_mic

8

Указать значения МПК по основному действующему веществу (например, триметоприм/сульфаметоксазол - МПК триметоприма) Согласно международному соглашению рекомендуется использовать значения, соответствующие двукратным разведениям начиная с 1 мг/л. Для значений менее 0,25 мг/л рекомендуется использовать следующие значения

0.125 00000002.wmz 0.125,

0.0625 00000003.wmz 0.06,

0.03125 00000004.wmz 0.03,

0.015625 00000005.wmz 0.016,

0.0078125 00000006.wmz 0.008,

0.00390625 00000007.wmz 0.004

0.001953125 00000008.wmz 0.002

Antibiotic_sir

S

Указать один вариант:

- S - чувствительный

- I - чувствительный при увеличенной экспозиции

- R - устойчивый

Antibiotic_dd

6

Указать диаметр зоны задержки роста по данным ДДМ. Целые числа, диапазон от 6 до 50 мм

Географическая локализация

Смоленск

Не рекомендуется использовать разное написание для одного географического объекта (если использовалась аббревиатура учреждения, то данное написание должно сохраняться в рамках всей таблицы, но не изменяться на полное название)

Локализация инфекции

Нижние дыхательные пути

Единое оформление по всему столбцу Сокращенный или полный вариант

Клинический материал

Бронхоальвеолярный лаваж

Единое оформление по всему столбцу Сокращенный или полный вариант

Отделение

Реанимация

Единое оформление по всему столбцу Сокращенный или полный вариант Аббревиатуры должны иметь поясняющие сноски

Возраст пациента

62

Единое оформление по всему столбцу Рекомендуется использовать количество полных лет, либо единые единицы измерения в рамках всей таблицы (годы, месяцы, дни)

Маркеры (резистентности/вирулентности)

CTX-M-15 (указать название маркера) Положительный;

Не обнаружено;

Пустая ячейка

Единое оформление по всему столбцу Каждая группа маркеров - отдельный столбец (например, карбапенемазы) Если определение маркера неприменимо, т.е. лишено биологического смысла (например, определение ESBL для стафилококков), ячейка должна остаться пустой. Во всех остальных случаях факт отсутствия маркера необходимо фиксировать (например: не определялся, не обнаружено).

Симптом заболевания

Да

Единое оформление по всему столбцу Особые маркеры заболевания, например симптомы, требующие регистрации среди группы пациентов/отделений (наличие лихорадки, маркеров воспаления и т.д.)

Данные локального мониторинга АМР, представленные в виде таблиц, оформленных в соответствие с вышеуказанными требованиями, должны подготавливаться ежемесячно и дополнять существующий набор данных локального мониторинга АМР медицинской организации. Таким образом, стандартизированные таблицы с данными локального мониторинга АМР медицинской организации загружаются в систему обработки данных.