Компенсацию затрат сотрудника на проезд к месту работы и обратно нужно установить в коллективном или трудовом договоре. Кроме того, такая выплата не должна быть социальной. Данный расход должен быть оплатой труда, следует из письма финансистов. При этих условиях возмещение можно списать по ст. 255 НК РФ.
Похожую точку зрения ведомство высказывало и об оплате проезда.