Безнадежный долг, возникший из-за ликвидации контрагента, включают во внереализационные расходы по налогу на прибыль в том периоде, в котором должника исключили из ЕГРЮЛ.
Если вы не сделали этого по ошибке, то можете включить безнадежный долг в расходы в том периоде, в котором налоговики обнаружили оплошность. Главное, чтобы еще не истекло три года со дня уплаты налога за период, в котором должника исключили из реестра.
Полагаем, так же можно поступить, если вы сами нашли ошибку.