В НК РФ есть ряд условий для освобождения от налога стимулирующих выплат в связи с коронавирусом. Например, суммы должны выплачиваться на основании федеральных законов, актов президента или Правительства РФ.
В прошлом году региональные доплаты предусматривало федеральное Постановление N 415. Москвы оно не касалось. В столице выплаты установило лишь региональное правительство. Поэтому освобождение от НДФЛ применять нельзя.