Речь идет об УСН с объектом "доходы минус расходы". Из разъяснения следует: если вы применяли пониженную ставку и налог за год оказался меньше минимального, нужно заплатить последний.
Ведомство ответило на вопрос о ставке 5%. Полагаем, разъяснение можно использовать и для других сниженных ставок по УСН, которые установили в регионе из-за коронавируса.