Полагаем, точка зрения ведомства основана на том, что налогоплательщиком является участник простого товарищества, ведущий общий учет, т.е. конкретное лицо. Если ответственный за налоги меняется, то плательщиком НДС становится другой товарищ, и вычет получать он не вправе.