При определении базы для взносов учтите все начисления с начала года. Обособленное подразделение, в которое перевели работника, для расчета предельной базы должно взять и выплаты, ранее начисленные другим подразделением.
Сумму НДФЛ, которую надо уплатить по месту нахождения "обособки", определите исходя из суммы налогооблагаемого дохода, начисленного и выплаченного работникам этого подразделения.