По общему правилу арест транспорта приставом не означает, что право собственности прекратили или автомобиль принудительно изъяли. Поэтому транспортный налог нужно продолжать платить.
Однако, если из постановления или акта об аресте (описи имущества) следует иное, действуют спецнормы НК РФ. Полагаем, речь идет о возможном принудительном изъятии.
Сходные разъяснения ФНС уже давала.