По НК РФ доходы от источников в России облагают НДФЛ. Это правило касается как резидентов, так и нерезидентов.
Доходы в виде компенсации лечения, аренды жилья и транспорта, полученные физлицами от российской организации, относят к источникам в РФ. Поэтому такие выплаты включают в базу по НДФЛ в общем порядке.