Проверяющие, скорее всего, сочтут нарушением, если налог не будет восстановлен. В практике такие споры не редкость. Суды обычно встают на сторону налогоплательщика, ведь ликвидация объектов до того, как истечет срок их полезного использования, не включена в перечень случаев, когда нужно восстановить НДС. Такого же мнения придерживался и ВАС РФ.
Минфин не раз высказывался в пользу восстановления НДС. В новом письме он отметил, что если товары, работы, услуги не используются для облагаемых НДС операций, то нет оснований принять "входной" налог к вычету. Можно предположить, что позиция финансового ведомства не изменилась.
Тем не менее с учетом судебной практики подобное дело, вероятнее всего, выиграет налогоплательщик.