Начиная с отчетности 2016 года учреждения не применяют Инструкцию N 33н, когда выступают заказчиками по контрактам, связанным с бюджетными инвестициями в объекты государственной и муниципальной собственности. Наиболее значимые учреждения науки, образования, культуры и здравоохранения не руководствуются Инструкцией N 33н, когда проводят операции в качестве главных распорядителей бюджетных средств.
С квартальной отчетности 2016 года вводятся новые формы – Отчет о движении денежных средств учреждения (ф. 0503723) и Сведения об исполнении судебных решений по денежным обязательствам учреждения (ф. 0503295).