Налоговая служба сослалась на позицию Пленума ВАС РФ: если по освобожденным операциям выставлен счет-фактура с НДС и налог уплачен в бюджет, значит, продавец вправе заявить вычет "входного" налога по этим операциям.
Вопрос, адресованный ФНС, касался аэроуслуг. Вывод ведомства можно использовать и в отношении других операций, по которым нельзя отказаться от применения освобождения. Даже если продавец-налогоплательщик дойдет в споре с инспекцией до суда, вероятность выиграть его велика.
В НК РФ есть и перечень освобожденных операций, по которым налогоплательщик вправе отказаться от освобождения. Если налогоплательщик-продавец проводит эти операции, сомнения по поводу вычета могут возникнуть в такой ситуации: заявление об отказе он не подавал, но фактически освобождение не использует, т.е. выставляет счета-фактуры с выделенным налогом, указывает его в декларациях и платит в бюджет.
В этом случае продавцу тоже можно принять "входной" налог по освобожденным операциям к вычету. Это объясняется так. Во-первых, Пленум ВАС РФ не уточнял, каких именно освобожденных операций касается его подход – по которым можно или нельзя отказаться от освобождения. Во-вторых, Минфин рекомендовал руководствоваться позицией высшего суда в вопросе о вычете НДС по освобожденным операциям, также не уточняя, по каким именно.
Следует, однако, обратить внимание, что в практике нижестоящих судов уже после опубликования позиции Пленума ВАС РФ встречается противоположный подход. Значит, продавцам лучше вовремя отказаться от освобождения операций, если они хотят принимать "входной" налог к вычету.