Из письма Минфина следует, что вместо этих слов допустимо внести в строки 2а и 6а, например, сокращения "г.", "ул.", "д.", "оф.". По такому счету-фактуре вычет можно будет применить без опасений. Неважно, что в ЕГРЮЛ указанные слова приведены полностью. Аналогичный вывод можно сделать и из другого письма.
Еще в одном разъяснении финансисты заверили, что ничего страшного нет и в использовании строчных букв. При этом в вопросе речь шла о написании "ул. Большая Дмитровка" вместо "ул. ДМИТРОВКА Б.".