Покупатель металлолома должен подать уточненную декларацию с исчисленным НДС за период, когда была отгрузка. Полученный позже счет-фактура не изменяет момент определения базы по НДС.
Напомним, налоговые агенты исчисляют налог на наиболее раннюю из дат: день отгрузки или оплаты.