ФНС считает, как и Минфин — платить взносы или нет, зависит от того, как вы оформили денежный вопрос:
Отметим: по мнению АС Поволжского округа, возмещение расходов работника на медосмотр не облагается взносами. Полагаем, вывод актуален и сейчас, когда страховые взносы (кроме взносов на травматизм) администрирует ФНС.
Так как налоговики считают, что старая практика уже неактуальна, чтобы избежать споров с ними, взносы лучше заплатить.