Организация на УСН выставляла контрагентам счета-фактуры с выделенной суммой НДС. Ссылаясь также на то, что ведет раздельный учет, она заявила к вычету "входной" налог. Инспекция с этим не согласилась. Суды трех инстанций ее поддержали.
Если неплательщик НДС выставляет счет-фактуру с налогом, то в силу прямого указания НК РФ он должен заплатить данную сумму в бюджет. Но это еще не означает, что он получает право на вычет "входного" налога. Такую позицию еще в 2014 году сформировал Пленум ВАС РФ. Ею продолжают руководствоваться и окружные суды (например, АС Восточно-Сибирского, Поволжского округов).
Таким образом, даже при выполнении всех формальных условий (первичка, принятие на учет, счета-фактуры, раздельный учет и т.п.) УСНщик не может принять к вычету "входной" налог. Если он это сделает, ему грозят доначисления и штрафы.