По закону при расчетах в безналичном порядке между организациями, а также организациями и ИП ККТ не применяется, за исключением ситуации, когда расчеты осуществляются с использованием электронного средства платежа с его предъявлением.
Поэтому, если учреждение осуществляет безналичные расчеты с юрлицами без предъявления электронного средства платежа, использовать ККТ оно не должно.