Контрагент компании, который применял УСН, выставил счета-фактуры с выделенной суммой НДС. После оплаты этих счетов-фактур организация приняла налог к вычету. Инспекция вычет "сняла", указав на то, что контрагент на спецрежиме.
Суды же с таким подходом не согласились. Счета-фактуры компания оплатила в полном объеме. Инспекция не смогла доказать, что организация действовала недобросовестно. Раз контрагент-УСНщик выставил счета-фактуры с НДС, то по НК РФ он обязан перечислить сумму налога в бюджет. Если он этого не сделал, негативные последствия должны наступить для него, а не для организации.
Такая судебная практика сложилась достаточно давно. А КС РФ еще в 2014 году признал право покупателя принимать к вычету НДС, который он заплатил по счету-фактуре, выставленному с налогом контрагентом на УСН. Однако Минфин даже после обнародования такой позиции КС РФ продолжал настаивать: права на вычет не возникает.