Организация неправильно распределяла вычеты НДС по операциям на внутренний рынок и на экспорт. По учетной политике она производила расчет ежемесячно. Налоговики, с которыми согласились суды, указали, что нужно это делать поквартально.
Инспекция пересчитала вычеты за несколько кварталов: в одних периодах налогоплательщик завысил вычеты, а в других — занизил. Конечно, налоговая только доначислила НДС и оштрафовала, а за другие периоды предложила подать уточненки. Обосновали проверяющие это тем, что вычеты носят заявительный характер.
Однако АС Северо-Западного округа посчитал такой подход несправедливым. Инспекция сама перераспределяла вычеты и сама признала, что компания занизила суммы возмещения, иными словами, появилась переплата. Поскольку долг перед бюджетом возник из-за расчетов инспекции, по мнению суда, ссылаться на заявительный характер вычетов проверяющие не могут.
Инспекция переквалифицировала затраты из единовременно принимаемых в расходы капитального характера, которые нужно списывать через амортизацию. При расчете недоимки по налогу на прибыль проверяющие "сняли" спорные расходы. А вот учесть почти все амортизационные отчисления предложили самому налогоплательщику в уточненках.
АС Московского округа встал на сторону организации. Инспекция должна была рассчитать действительные налоговые обязательства, иначе говоря, учесть и доходы, и расходы.
Проверяющие пытались сослаться на то, что на расчет у них было мало времени (всего месяц). Однако суд это не разжалобило: инспекция должна определять реальные обязательства налогоплательщика не на основании его возражений на акт, а в течение всего периода проверки.