Ответ на вопрос, как начислять взносы по доптарифу при частичной занятости, зависит от того, ведете ли вы раздельный учет выплат за вредную работу.
Если да, то взносы по доптарифу начисляйте только на выплаты за такую работу.
Если же нет, то все выплаты работнику, который трудится и на вредных работах, и на работах с нормальными условиями труда, нужно разделить пропорционально фактически отработанному времени. Взносы по доптарифу начисляйте только на ту часть, которая приходится на вредную работу.
Имейте в виду: если вы выплачиваете сотруднику суммы, которые не связаны с работой в тех или иных условиях труда (например, матпомощь или оплата путевки), то начислите на них взносы по доптарифу. Сделайте это пропорционально количеству дней или часов, фактически отработанных на вредных работах.
ФНС и Минфин уже выпускали похожее разъяснение.